Bos taurus Protein: SNW1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-699749.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNW1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | SNW domain-containing protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NCOA-62; SKIIP; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSBTAP00000010697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-646903 (SNW1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Involved in transcriptional regulation. Modulates TGF- beta-mediated transcription via association with SMAD proteins, MYOD1-mediated transcription via association with PABPN1, RB1- mediated transcriptional repression, and retinoid-X receptor (RXR)- and vitamin D receptor (VDR)-dependent gene transcription in a cell line-specific manner probably involving coactivators NCOA1 and GRIP1. Is involved in NOTCH1-mediated transcriptional activation. Binds to multimerized forms of notch intracellular domain (NICD) and is proposed to recruit transcriptional coactivators such as MAML1 to form an intermediate preactivation complex which associates with DNA-bound CBF-1/RBPJ to form a transcriptional activation complex by releasing SNW1 and redundant NOTCH1 NICD. Functions as a splicing factor in pre-mRNA splicing. Is required in the specific splicing of CDKN1A pre-mRNA; the function probbaly involves the recruitment of U2AF2 to the mRNA. Is proposed to recruit PPIL1 to the spliceosome. May be involved in cyclin-D1/CCND1 mRNA stability through the SNARP complex which associates with both the 3'end of the CCND1 gene and its mRNA (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 118 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004015
SKI-interacting protein SKIP, SNW domain IPR013822 Signal recognition particle, SRP54 subunit, helical bundle |
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PFAM |
PF02731
PF02881 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00963
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q1JQE0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 326578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.42459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001071302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC116009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI16010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||