Bos taurus Gene: SNW1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-646903.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNW1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SNW domain-containing protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NCOA-62; SKIIP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000008136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SNW domain-containing protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000100603:
This gene, a member of the SNW gene family, encodes a coactivator that enhances transcription from some Pol II promoters. This coactivator can bind to the ligand-binding domain of the vitamin D receptor and to retinoid receptors to enhance vitamin D-, retinoic acid-, estrogen-, and glucocorticoid-mediated gene expression. It can also function as a splicing factor by interacting with poly(A)-binding protein 2 to directly control the expression of muscle-specific genes at the transcriptional level. Finally, the protein may be involved in oncogenesis since it interacts with a region of SKI oncoproteins that is required for transforming activity. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:89923193-89958906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 118 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Signaling by NOTCH pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
Gene Expression pathway
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
Notch-HLH transcription pathway pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME |
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
Pre-NOTCH Transcription and Translation pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
Notch-HLH transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Pre-NOTCH Expression and Processing pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Notch signaling pathway pathway
Spliceosome pathway
Notch signaling pathway pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.42459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001077834 XM_005212137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||