Homo sapiens Protein: KDM4D | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-718708.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDM4D | ||||||||||||||||||
Protein Name | |||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000460897 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-68444 (KDM4D) | ||||||||||||||||||
Protein Structure |
![]() |
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UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Histone demethylase that specifically demethylates 'Lys- 9' of histone H3, thereby playing a central role in histone code. Does not demethylate histone H3 'Lys-4', H3 'Lys-27', H3 'Lys-36' nor H4 'Lys-20'. Demethylates both di- and trimethylated H3 'Lys- 9' residue, while it has no activity on monomethylated residues. Demethylation of Lys residue generates formaldehyde and succinate. {ECO:0000269PubMed:16603238}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00537}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003347
JmjC domain IPR003349 Transcription factor jumonji, JmjN |
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PFAM |
PF02373
PF08007 PF02375 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00558
SM00545 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q6B0I6 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q6B0I6 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 55693 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.613666 | ||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:25498 | ||||||||||||||||||
OMIM | 609766 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8302 | ||||||||||||||||||
HPRD | 17169 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AK001113 AK056162 AL137545 AP002383 BC074739 BC119010 BC122858 CH471065 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH74739 AAI19011 AAI22859 BAA91508 BAG51636 CAB70803 EAW66952 | ||||||||||||||||||