Version 5.4
| Homo sapiens Protein: KDM4D | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-718708.3 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | KDM4D | ||||||||||||||||||
| Protein Name | |||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000460897 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-68444 (KDM4D) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Histone demethylase that specifically demethylates 'Lys- 9' of histone H3, thereby playing a central role in histone code. Does not demethylate histone H3 'Lys-4', H3 'Lys-27', H3 'Lys-36' nor H4 'Lys-20'. Demethylates both di- and trimethylated H3 'Lys- 9' residue, while it has no activity on monomethylated residues. Demethylation of Lys residue generates formaldehyde and succinate. {ECO:0000269PubMed:16603238}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00537}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR003347
JmjC domain IPR003349 Transcription factor jumonji, JmjN |
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| PFAM |
PF02373
PF08007 PF02375 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00558
SM00545 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q6B0I6 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q6B0I6 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 55693 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.613666 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | |||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:25498 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 609766 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS8302 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 17169 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AK001113 AK056162 AL137545 AP002383 BC074739 BC119010 BC122858 CH471065 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH74739 AAI19011 AAI22859 BAA91508 BAG51636 CAB70803 EAW66952 | ||||||||||||||||||