Mus musculus Protein: Prpf31 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-722339.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prpf31 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | |||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1500019O16Rik; 2810404O06Rik; AW554706; PRP31; RP11; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000136031 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-135774 (Prpf31) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in pre-mRNA splicing. Required for the assembly of the U4/U5/U6 tri-snRNP complex, one of the building blocks of the spliceosome (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000250}. Nucleus, Cajal body {ECO:0000250}. Note=Predominantly found in speckles and in Cajal bodies. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 43 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1916238 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002687
Nop domain IPR012976 NOSIC IPR019175 Prp31 C-terminal |
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PFAM |
PF01798
PF08060 PF09785 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00931
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8CCF0 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8CCF0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 68988 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.246863 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001153186 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prpf31 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS51965 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC130680 AK005294 AK033190 AK033283 AK044398 AK044457 AK051260 AY040823 BC018376 BC057877 BC061461 CT010189 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH18376 AAH57877 AAH61461 AAK77987 BAC25109 BAC28192 BAC28220 BAC31903 BAC31931 BAC34578 CAJ18397 | ||||||||||||||||||||||