Homo sapiens Protein: TRIM27 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-72255.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tripartite motif containing 27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | RFP; RNF76; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000366404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-72253 (TRIM27) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure |
![]() |
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UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase that mediates ubiquitination of PIK3C2B and inhibits its activity; mediates the formation of 'Lys-48'-linked polyubiquitin chains; the function inhibits CD4 T- cell activation. Acts as a regulator of retrograde transport: together with MAGEL2, mediates the formation of 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains at 'Lys-220' of WASH1, leading to promote endosomal F-actin assembly (PubMed:23452853). Has a transcriptional repressor activity by cooperating with EPC1. Induces apoptosis by activating Jun N-terminal kinase and p38 kinase and also increases caspase-3-like activity independently of mitochondrial events. May function in male germ cell development. Has DNA-binding activity and preferentially bound to double- stranded DNA. {ECO:0000269PubMed:10976108, ECO:0000269PubMed:12807881, ECO:0000269PubMed:22128329, ECO:0000269PubMed:23452853}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus, PML body {ECO:0000250}. Early endosome {ECO:0000269PubMed:1437549, ECO:0000269PubMed:23452853, ECO:0000269PubMed:9247190}. Note=Nuclear or cytoplasmic depending on the cell type (By similarity). Colocalized with PML and EIF3S6 in nuclear bodies. Recruited to retromer-containing endosomes via interaction with MAGEL2 (PubMed:23452853). {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:23452853}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Thyroid papillary carcinoma (TPC) [MIM:188550]: A common tumor of the thyroid that typically arises as an irregular, solid or cystic mass from otherwise normal thyroid tissue. Papillary carcinomas are malignant neoplasm characterized by the formation of numerous, irregular, finger-like projections of fibrous stroma that is covered with a surface layer of neoplastic epithelial cells. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. A chromosomal aberration involving TRIM27/RFP is found in thyroid papillary carcinomas. Translocation t(6;10)(p21.3;q11.2) with RET. The translocation generates TRIM27/RET and delta TRIM27/RET oncogenes. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in testis namely within the seminiferous tubules. {ECO:0000269PubMed:12445133}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 154 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000315
Zinc finger, B-box IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR001870 B30.2/SPRY domain IPR003877 SPRY domain IPR003879 Butyrophylin-like IPR006574 SPRY-associated IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type IPR020457 Zinc finger, B-box, chordata |
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PFAM |
PF00643
PF13639 PF14634 PF00622 PF13765 PF00097 |
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PRINTS |
PR01407
PR01406 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00336
SM00184 SM00449 SM00589 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P14373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P14373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9NZT8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.614196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_006501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 15996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF171101 AF230393 AF230394 AL662859 AL662871 BC013580 BC066924 BX000360 BX005144 BX119924 BX537153 CH471081 CR759942 J03407 Z84474 Z84476 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36564 AAF32265 AAG50172 AAG50173 AAH13580 AAH66924 CAB06480 CAI17553 CAI18381 CAI18618 CAI18619 CAI18645 CAI18646 CAI19959 CAM24901 CAM25659 CAM25871 CAM25872 CAM26230 CAM26231 CAQ07942 CAQ07943 EAX03176 EAX03177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||