Homo sapiens Protein: CIR1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-75365.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CIR1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | corepressor interacting with RBPJ, 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CIR; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000339723 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-75361 (CIR1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May modulate splice site selection during alternative splicing of pre-mRNAs (By similarity). Regulates transcription and acts as corepressor for RBPJ. Recruits RBPJ to the Sin3-histone deacetylase complex (HDAC). Required for RBPJ-mediated repression of transcription. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:19409814, ECO:0000269PubMed:9874765}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle. Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome. Note=Colocalizes with NEK6 in the centrosome. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in heart, brain, placenta, liver, skeletal muscle and pancreas. {ECO:0000269PubMed:9874765}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 20 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001878
Zinc finger, CCHC-type IPR019339 CBF1-interacting co-repressor CIR, N-terminal domain |
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PFAM |
PF00098
PF10197 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00343
SM01083 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q86X95 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q86X95 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9541 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.709031 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004873 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:24217 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605228 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2256 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05568 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC018470 AF098297 AK292389 BC015040 BC021175 BC038987 BC046098 U03644 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA17853 AAD05243 AAH21175 AAH38987 AAH46098 AAY24216 BAF85078 | ||||||||||||||||||||||