Homo sapiens Protein: PHF2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-76771.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PHF2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PHD finger protein 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CENP-35; GRC5; JHDM1E; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000352185 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-76769 (PHF2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Lysine demethylase that demethylates both histones and non-histone proteins. Enzymatically inactive by itself, and becomes active following phosphorylation by PKA: forms a complex with ARID5B and mediates demethylation of methylated ARID5B. Demethylation of ARID5B leads to target the PHF2-ARID5B complex to target promoters, where PHF2 mediates demethylation of dimethylated 'Lys-9' of histone H3 (H3K9me2), followed by transcription activation of target genes. The PHF2-ARID5B complex acts as a coactivator of HNF4A in liver. PHF2 is recruited to trimethylated 'Lys-4' of histone H3 (H3K4me3) at rDNA promoters and promotes expression of rDNA. {ECO:0000269PubMed:20129925, ECO:0000269PubMed:21167174, ECO:0000269PubMed:21532585}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000269PubMed:20129925}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed, including in liver (at protein level). {ECO:0000269PubMed:21532585}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001965
Zinc finger, PHD-type IPR003347 JmjC domain IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR019787 Zinc finger, PHD-finger |
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PFAM |
PF02373
PF08007 PF00628 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00249
SM00558 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O75151 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O75151 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5253 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.707326 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_005383 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8920 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 604351 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35069 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05071 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB014562 AF043725 AL353629 AL359181 AL834263 CH471089 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD21791 BAA31637 CAD38938 CAI96110 CAI96111 EAW62867 | ||||||||||||||||||||||