Homo sapiens Protein: SMC2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-79197.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SMC2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | structural maintenance of chromosomes 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CAP-E; CAPE; SMC-2; SMC2L1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000286398 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-79195 (SMC2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Central component of the condensin complex, a complex required for conversion of interphase chromatin into mitotic-like condense chromosomes. The condensin complex probably introduces positive supercoils into relaxed DNA in the presence of type I topoisomerases and converts nicked DNA into positive knotted forms in the presence of type II topoisomerases. {ECO:0000269PubMed:11136719}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:10958694}. Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:10958694}. Chromosome {ECO:0000269PubMed:10958694}. Note=In interphase cells, the majority of the condensin complex is found in the cytoplasm, while a minority of the complex is associated with chromatin. A subpopulation of the complex however remains associated with chromosome foci in interphase cells. During mitosis, most of the condensin complex is associated with the chromatin. At the onset of prophase, the regulatory subunits of the complex are phosphorylated by CDC2, leading to condensin's association with chromosome arms and to chromosome condensation. Dissociation from chromosomes is observed in late telophase. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 54 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003395
RecF/RecN/SMC, N-terminal IPR010935 SMCs flexible hinge IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF02463
PF06470 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00968
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O95347 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O95347 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5T821 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10592 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.119023 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_006435 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14011 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605576 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35086 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09277 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF092563 AF113673 AL161791 AL354938 AL833191 BC130385 BN000163 CH471105 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC72360 AAF29579 AAI30386 CAD89875 CAI16866 CAI16923 CAI46187 EAW58973 EAW58975 EAW58977 | ||||||||||||||||||||||