Version 5.4
| Homo sapiens Protein: COL27A1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-82021.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | COL27A1 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | collagen, type XXVII, alpha 1 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000348385 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-82019 (COL27A1) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Plays a role during the calcification of cartilage and the transition of cartilage to bone. {ECO:0000269PubMed:17693149}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix. Note=Found on some small banded collagen fibrils and meshworks. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR000885
Fibrillar collagen, C-terminal IPR001791 Laminin G domain IPR008160 Collagen triple helix repeat IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily |
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| PFAM |
PF01410
PF00054 PF02210 PF01391 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00038
SM00210 SM00282 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q8IZC6 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q8IZC6 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 85301 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.604321 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_116277 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:22986 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 608461 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS6802 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 09767 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB058773 AL356796 AL445543 AY149237 BC080610 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH80610 AAN41263 BAB47499 CAI14772 CAI16857 | ||||||||||||||||||