Homo sapiens Protein: TNC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-82350.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TNC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tenascin C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 150-225; DFNA56; GMEM; GP; HXB; JI; TN; TN-C; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000265131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-82348 (TNC) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Extracellular matrix protein implicated in guidance of migrating neurons as well as axons during development, synaptic plasticity as well as neuronal regeneration. Promotes neurite outgrowth from cortical neurons grown on a monolayer of astrocytes. Ligand for integrins alpha-8/beta-1, alpha-9/beta-1, alpha-V/beta-3 and alpha-V/beta-6. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Deafness, autosomal dominant, 56 (DFNA56) [MIM:615629]: A form of non-syndromic sensorineural hearing loss. Sensorineural deafness results from damage to the neural receptors of the inner ear, the nerve pathways to the brain, or the area of the brain that receives sound information. DFNA56 is characterized by progressive hearing impairment with post-lingual onset. {ECO:0000269PubMed:23936043}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000742
Epidermal growth factor-like domain IPR002181 Fibrinogen, alpha/beta/gamma chain, C-terminal globular domain IPR003961 Fibronectin, type III IPR013111 EGF-like domain, extracellular |
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PFAM |
PF00008
PF00147 PF00041 PF01108 PF07974 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00181
SM00186 SM00060 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P24821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P24821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F5H5D6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3371 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.684865 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 187380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6811 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL162425 M24630 M55618 X56160 X78565 X80280 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA52703 AAA88083 CAA39628 CAA55309 CAI15110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||