Homo sapiens Protein: HDAC4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-84596.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HDAC4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | histone deacetylase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AHO3; BDMR; HA6116; HD4; HDAC-4; HDAC-A; HDACA; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000264606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-84594 (HDAC4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Responsible for the deacetylation of lysine residues on the N-terminal part of the core histones (H2A, H2B, H3 and H4). Histone deacetylation gives a tag for epigenetic repression and plays an important role in transcriptional regulation, cell cycle progression and developmental events. Histone deacetylases act via the formation of large multiprotein complexes. Involved in muscle maturation via its interaction with the myocyte enhancer factors such as MEF2A, MEF2C and MEF2D. Involved in the MTA1-mediated epigenetic regulation of ESR1 expression in breast cancer. {ECO:0000269PubMed:10523670, ECO:0000269PubMed:24413532}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm. Note=Shuttles between the nucleus and the cytoplasm. Upon muscle cells differentiation, it accumulates in the nuclei of myotubes, suggesting a positive role of nuclear HDAC4 in muscle differentiation. The export to cytoplasm depends on the interaction with a 14-3-3 chaperone protein and is due to its phosphorylation at Ser-246, Ser-467 and Ser-632 by CaMK4 and SIK1. The nuclear localization probably depends on sumoylation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Brachydactyly-mental retardation syndrome (BDMR) [MIM:600430]: A syndrome resembling the physical anomalies found in Albright hereditary osteodystrophy. Common features are mild facial dysmorphism, congenital heart defects, distinct brachydactyly type E, mental retardation, developmental delay, seizures, autism spectrum disorder, and stocky build. Soft tissue ossification is absent, and there are no abnormalities in parathyroid hormone or calcium metabolism. {ECO:0000269PubMed:20691407}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 253 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 21 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000286
Histone deacetylase superfamily IPR017320 Histone deacetylase class II, eukaryotic IPR019154 Arb2 domain IPR023801 Histone deacetylase domain IPR024643 Histone deacetylase, glutamine rich N-terminal domain |
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PFAM |
PF09757
PF00850 PF12203 |
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PRINTS |
PR01270
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PIRSF |
PIRSF037911
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SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P56524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P56524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q53SM2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.599215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_006028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14063 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 605314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB006626 AC017028 AC062017 AF132607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD29046 AAX93070 AAX93254 BAA22957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||