Homo sapiens Gene: RAP1A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-101087.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RAP1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | RAP1A, member of RAS oncogene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C21KG; G-22K; KREV-1; KREV1; RAP1; SMGP21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000116473 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RAP1A, member of RAS oncogene family
RAP1A, member of RAS oncogene family
RAP1A, member of RAS oncogene family
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The product of this gene belongs to the family of RAS-related proteins. These proteins share approximately 50% amino acid identity with the classical RAS proteins and have numerous structural features in common. The most striking difference between RAP proteins and RAS proteins resides in their 61st amino acid: glutamine in RAS is replaced by threonine in RAP proteins. The product of this gene counteracts the mitogenic function of RAS because it can interact with RAS GAPs and RAF in a competitive manner. Two transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a member of the Ras family of small GTPases. The encoded protein undergoes a change in conformational state and activity, depending on whether it is bound to GTP or GDP. This protein is activated by several types of guanine nucleotide exchange factors (GEFs), and inactivated by two groups of GTPase-activating proteins (GAPs). The activation status of the encoded protein is therefore affected by the balance of intracellular levels of GEFs and GAPs. The encoded protein regulates signaling pathways that affect cell proliferation and adhesion, and may play a role in tumor malignancy. Pseudogenes of this gene have been defined on chromosomes 14 and 17. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:111542218-111716691 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 64 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
TCR pathway
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REACTOME |
Rap1 signalling pathway
GRB2:SOS provides linkage to MAPK signaling for Integrins pathway
p130Cas linkage to MAPK signaling for integrins pathway
Integrin alphaIIb beta3 signaling pathway
Platelet Aggregation (Plug Formation) pathway
Frs2-mediated activation pathway
ARMS-mediated activation pathway
Glucagon-like Peptide-1 (GLP1) regulates insulin secretion pathway
Regulation of insulin secretion pathway
Integration of energy metabolism pathway
Signalling by NGF pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Signal Transduction pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Signalling to ERKs pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
Prolonged ERK activation events pathway
Metabolism pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Renal cell carcinoma pathway
MAPK signaling pathway pathway
Long-term potentiation pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Focal adhesion pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Chemokine signaling pathway pathway
Pancreatic secretion pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
GPCR Adenosine A2A receptor signaling pathway pathway
HGF signaling pathway pathway
GPCR signaling pathway
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PID NCI |
TCR signaling in naïve CD8+ T cells
Class I PI3K signaling events
Reelin signaling pathway
TCR signaling in naïve CD4+ T cells
EPO signaling pathway
Signaling events regulated by Ret tyrosine kinase
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P62834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A8KAH9 F8WBC0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.190334 Hs.586618 Hs.593298 Hs.605098 Hs.632972 Hs.642019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001010935 NM_001291896 NM_002884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9855 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 179520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB451235 AB451360 AC015550 AF493912 AK293044 AL049557 BC014086 CH471122 M22995 X12533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36150 AAH14086 AAM12626 BAF85733 BAG70049 BAG70174 CAA31051 CAB55685 EAW56503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||