Homo sapiens Gene: SEPSECS | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-12103.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEPSECS | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000109618 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The amino acid selenocysteine is the only amino acid that does not have its own tRNA synthetase. Instead, this amino acid is synthesized on its cognate tRNA in a three step process. The protein encoded by this gene catalyzes the third step in the process, the conversion of O-phosphoseryl-tRNA(Sec) to selenocysteinyl-tRNA(Sec).[provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:25120014-25160442 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p15.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Selenocompound metabolism pathway
Aminoacyl-tRNA biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9HD40 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 51091 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.253305 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016955 XM_005248168 XM_006713965 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:30605 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 613009 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3432 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 11561 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC007073 AC104662 AF146396 AF282065 AJ238617 AJ277541 AK292476 BC023539 BC117202 BX648976 CH471069 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD33963 AAG00491 AAH23539 AAI17203 BAF85165 CAB62209 CAB89517 EAW92832 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 51091 | ||||||||||||||||||||||