Mus musculus Gene: Sepsecs | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-163914.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sepsecs | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029173 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000109618:
The amino acid selenocysteine is the only amino acid that does not have its own tRNA synthetase. Instead, this amino acid is synthesized on its cognate tRNA in a three step process. The protein encoded by this gene catalyzes the third step in the process, the conversion of O-phosphoseryl-tRNA(Sec) to selenocysteinyl-tRNA(Sec).[provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:52640087-52669729 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Aminoacyl-tRNA biosynthesis pathway
Selenocompound metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Selenocompound metabolism pathway
Aminoacyl-tRNA biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.244719 Mm.405806 Mm.475590 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_172490 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19286 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||