Homo sapiens Gene: RBPJ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-12527.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBPJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AOS3; CBF1; csl; IGKJRB; IGKJRB1; KBF2; RBP-J; RBPJK; RBPSUH; SUH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000168214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
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recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a transcriptional regulator important in the Notch signaling pathway. The encoded protein acts as a repressor when not bound to Notch proteins and an activator when bound to Notch proteins. It is thought to function by recruiting chromatin remodeling complexes containing histone deacetylase or histone acetylase proteins to Notch signaling pathway genes. Also, this protein can bind specifically to the recombination signal sequence of immunglobulin kappa type J segments. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene, and several pseudogenes of this gene exist on chromosome 9. [provided by RefSeq, Oct 2011] The protein encoded by this gene is a transcriptional regulator important in the Notch signaling pathway. The encoded protein acts as a repressor when not bound to Notch proteins and an activator when bound to Notch proteins. It is thought to function by recruiting chromatin remodeling complexes containing histone deacetylase or histone acetylase proteins to Notch signaling pathway genes. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene, and several pseudogenes of this gene exist on chromosome 9. [provided by RefSeq, Oct 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:26163455-26435131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p15.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 66 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 18 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
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REACTOME |
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
Pre-NOTCH Transcription and Translation pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
Notch-HLH transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Regulation of gene expression in late stage (branching morphogenesis) pancreatic bud precursor cells pathway
Developmental Biology pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Pre-NOTCH Expression and Processing pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
Regulation of beta-cell development pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by NOTCH2 pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
NOTCH2 intracellular domain regulates transcription pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Notch signaling pathway pathway
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INOH |
Notch signaling pathway pathway
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PID NCI |
Presenilin action in Notch and Wnt signaling
Notch-mediated HES/HEY network
Notch signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RE93 D6REP3 D6RF98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.479396 Hs.593474 Hs.604926 Hs.628188 Hs.732091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_005349 NM_015874 NM_203283 NM_203284 XM_005248161 XM_006713962 XM_006713963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5724 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 147183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33969 CCDS3436 CCDS3437 CCDS43219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00920 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC093637 AC097109 AC097714 AC111003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||