Mus musculus Gene: Cdh17 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-129666.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cdh17 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | cadherin 17 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | HPT-1; HPT-1/LI | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028217 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cadherin 17
cadherin 17
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000079112:
This gene is a member of the cadherin superfamily, genes encoding calcium-dependent, membrane-associated glycoproteins. The encoded protein is cadherin-like, consisting of an extracellular region, containing 7 cadherin domains, and a transmembrane region but lacking the conserved cytoplasmic domain. The protein is a component of the gastrointestinal tract and pancreatic ducts, acting as an intestinal proton-dependent peptide transporter in the first step in oral absorption of many medically important peptide-based drugs. The protein may also play a role in the morphological organization of liver and intestine. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:11758147-11817895 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell-cell junction organization pathway
Adherens junctions interactions pathway
Cell junction organization pathway
Cell-Cell communication pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Adherens junctions interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell junction organization pathway
Cell-cell junction organization pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.33402 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_019753 XM_006537583 XM_006537584 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17972 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||