Mus musculus Gene: Arid4b | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131316.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Arid4b | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | AT rich interactive domain 4B (RBP1-like) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BCAA; BRCAA1; RBBP1L1; Rbp1l1; SAP180 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000039219 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000054267:
This gene encodes a protein with sequence similarity to retinoblastoma-binding protein-1. The encoded protein is a subunit of the histone deacetylase-dependant SIN3A transcriptional corepressor complex, which functions in diverse cellular processes including proliferation, differentiation, apoptosis, oncogenesis, and cell fate determination. The gene product is recognized by IgG antibody isolated from a breast cancer patient and appears to be a molecular marker associated with a broad range of human malignancies. Alternate transcriptional splice variants encoding different isoforms have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:14063232-14199603 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
HDACs deacetylate histones pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Epigenetic regulation of gene expression pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 94246 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.436478 Mm.439784 Mm.450893 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_194262 NM_198122 XM_006516806 XM_006516807 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36599 CCDS36600 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2137512 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Arid4b | ||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 94246 | ||||||||||||||||||||||