Homo sapiens Gene: ARID4B | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-107534.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ARID4B | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | AT rich interactive domain 4B (RBP1-like) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000054267 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein with sequence similarity to retinoblastoma-binding protein-1. The encoded protein is a subunit of the histone deacetylase-dependant SIN3A transcriptional corepressor complex, which functions in diverse cellular processes including proliferation, differentiation, apoptosis, oncogenesis, and cell fate determination. The gene product is recognized by IgG antibody isolated from a breast cancer patient and appears to be a molecular marker associated with a broad range of human malignancies. Alternate transcriptional splice variants encoding different isoforms have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:235131634-235328219 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q42.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Epigenetic regulation of gene expression pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.575782 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001206794 NM_016374 NM_031371 XM_005273160 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31060 CCDS31061 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10661 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||