Mus musculus Gene: Capn1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-133910.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Capn1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | calpain 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Capa-1; Capa1; mu-calpin | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024942 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
calpain 1
calpain 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000014216:
The calpains, calcium-activated neutral proteases, are nonlysosomal, intracellular cysteine proteases. The mammalian calpains include ubiquitous, stomach-specific, and muscle-specific proteins. The ubiquitous enzymes consist of heterodimers with distinct large, catalytic subunits associated with a common small, regulatory subunit. This gene encodes the large subunit of the ubiquitous enzyme, calpain 1. Several transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:5988546-6015825 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 45 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
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KEGG |
Alzheimer's disease pathway
Apoptosis pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
RANKL pathway
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REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
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KEGG |
Apoptosis pathway
Alzheimer's disease pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by PTP1B
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.6221 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001110504 NM_007600 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37893 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||