Mus musculus Gene: Phyh | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-133987.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Phyh | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | phytanoyl-CoA hydroxylase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI256161; AI265699; Lnap1; PAHX | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026664 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
phytanoyl-CoA hydroxylase
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000107537:
This gene is a member of the PhyH family and encodes a peroxisomal protein that is involved in the alpha-oxidation of 3-methyl branched fatty acids. Specifically, this protein converts phytanoyl-CoA to 2-hydroxyphytanoyl-CoA. Mutations in this gene have been associated with Refsum disease (RD) and deficient protein activity has been associated with Zellweger syndrome and rhizomelic chondrodysplasia punctata. Alternate transcriptional splice variants, encoding different isoforms, have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:4919019-4938730 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Metabolism pathway
Alpha-oxidation of phytanate pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Peroxisomal lipid metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Peroxisome pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Alpha-oxidation of phytanate pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Peroxisomal lipid metabolism pathway
Metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Peroxisome pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O35386 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3TPC7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16922 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.391704 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010726 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15660 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:891978 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Phyh | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF023463 AK146753 AK164495 AK165412 AK169213 BC002018 CH466542 D88670 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB81835 AAH02018 BAA19003 BAE27410 BAE37810 BAE38170 BAE40985 EDL07951 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 16922 | ||||||||||||||||||||||