Mus musculus Gene: Vta1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-134675.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vta1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110001D18Rik; 1110059P08Rik; AU040813; C85340; LIP5; SBP1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000019868 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae)
Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae)
Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae)
Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000009844:
C6ORF55 encodes a protein involved in trafficking of the multivesicular body, an endosomal compartment involved in sorting membrane proteins for degradation in lysosomes (Ward et al., 2005 [PubMed 15644320]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:14654755-14705560 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 25 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Membrane Trafficking pathway
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) pathway
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KEGG |
Endocytosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Budding and maturation of HIV virion pathway
Disease pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG |
Endocytosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_025418 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23705 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||