Homo sapiens Gene: VTA1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-97190.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VTA1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000009844 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae)
Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae)
Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae)
vesicle (multivesicular body) trafficking 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
C6ORF55 encodes a protein involved in trafficking of the multivesicular body, an endosomal compartment involved in sorting membrane proteins for degradation in lysosomes (Ward et al., 2005 [PubMed 15644320]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:142147162-142224689 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q24.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 30 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Budding and maturation of HIV virion pathway
Disease pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG |
Endocytosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001286371 NM_001286372 NM_016485 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5197 CCDS69214 CCDS75531 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||