Mus musculus Gene: Aptx | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-136241.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Aptx | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | aprataxin | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2410016G21Rik; AA388047; FHA-HIT | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028411 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
aprataxin
aprataxin
aprataxin
aprataxin
aprataxin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000137074:
This gene encodes a member of the histidine triad (HIT) superfamily. The encoded protein may play a role in single-stranded DNA repair through its nucleotide-binding activity and its diadenosine polyphosphate hydrolase activity. Mutations in this gene have been associated with ataxia-ocular apraxia. Alternatively spliced transcript variants have been identified for this gene.[provided by RefSeq, Aug 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:40682382-40703194 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | A5 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.421685 Mm.430710 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001025444 NM_001025445 NM_025545 XM_006538166 XM_006538167 XM_006538168 XM_006538169 XM_006538170 XM_006538171 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38711 CCDS38712 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||