Homo sapiens Gene: APTX | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-56157.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | APTX | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | aprataxin | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000137074 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
aprataxin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the histidine triad (HIT) superfamily. The encoded protein may play a role in single-stranded DNA repair through its nucleotide-binding activity and its diadenosine polyphosphate hydrolase activity. Mutations in this gene have been associated with ataxia-ocular apraxia. Alternatively spliced transcript variants have been identified for this gene.[provided by RefSeq, Aug 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:32972606-33025168 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 26 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.20158 Hs.706131 Hs.734329 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001195248 NM_001195249 NM_001195250 NM_001195251 NM_001195252 NM_001195254 NM_175069 NM_175073 XM_006716791 XM_006716792 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47956 CCDS56568 CCDS75827 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05892 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||