Mus musculus Gene: Nfx1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-136741.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nfx1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear transcription factor, X-box binding 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1300017N15Rik; 3000003M19Rik; NFX.1; TEG-42; Tex42 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028423 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear transcription factor, X-box binding 1
nuclear transcription factor, X-box binding 1
nuclear transcription factor, X-box binding 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000086102:
MHC class II gene expression is controlled primarily at the transcriptional level by transcription factors that bind to the X and Y boxes, two highly conserved elements in the proximal promoter of MHC class II genes. The protein encoded by this gene is a transcriptional repressor capable of binding to the conserved X box motif of HLA-DRA and other MHC class II genes in vitro. The protein may play a role in regulating the duration of an inflammatory response by limiting the period in which class II MHC molecules are induced by IFN-gamma. Three alternative splice variants, each of which encodes a different isoform, have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:40970906-41025993 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A5 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 32 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH |
Tryptophan degradation pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.247456 Mm.399601 Mm.402765 Mm.407348 Mm.427435 Mm.427888 Mm.428377 Mm.429314 Mm.447670 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001290448 NM_001290449 NM_023739 XM_006538318 XM_006538320 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18054 CCDS71359 CCDS71360 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||