Homo sapiens Gene: NFX1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-57493.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NFX1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear transcription factor, X-box binding 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | NFX2; TEG-42; Tex42 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000086102 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear transcription factor, X-box binding 1
nuclear transcription factor, X-box binding 1
nuclear transcription factor, X-box binding 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
MHC class II gene expression is controlled primarily at the transcriptional level by transcription factors that bind to the X and Y boxes, two highly conserved elements in the proximal promoter of MHC class II genes. The protein encoded by this gene is a transcriptional repressor capable of binding to the conserved X box motif of HLA-DRA and other MHC class II genes in vitro. The protein may play a role in regulating the duration of an inflammatory response by limiting the period in which class II MHC molecules are induced by IFN-gamma. Three alternative splice variants, each of which encodes a different isoform, have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:33290511-33371157 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 42 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH |
Tryptophan degradation pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.413074 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002504 NM_147133 NM_147134 XM_005251473 XM_005251474 XM_005251475 XM_006716776 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6538 CCDS6539 CCDS6540 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 11936 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||