Mus musculus Gene: Trim38 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-137277.6 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trim38 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif-containing 38 | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000064140 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif-containing 38
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TRIM38 targets TICAM1 (TRIF) for degradation to negatively regulateTLR3-mediated IFNB signalling.
[Homo sapiens] TRIM38 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000112343:
This gene encodes a member of the tripartite motif (TRIM) family. The encoded protein contains a RING-type zinc finger, B box-type zinc finger and SPRY domain. The function of this protein has not been identified. A pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 4. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:23782572-23791495 | ||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||
Band | A3.1 | ||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.314151 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001029935 XM_006516636 XM_006516637 | ||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26370 | ||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||