Homo sapiens Gene: TRIM38 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-66673.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM38 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif containing 38 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | RNF15; RORET | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000112343 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif containing 38
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
TRIM38 targets TICAM1 (TRIF) for degradation to negatively regulateTLR3-mediated IFNB signalling.
TRIM38 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the tripartite motif (TRIM) family. The encoded protein contains a RING-type zinc finger, B box-type zinc finger and SPRY domain. The function of this protein has not been identified. A pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 4. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:25962802-25987156 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p22.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 20 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O00635 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024QZY4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10475 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.584851 Hs.597352 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_006355 XM_005248799 XM_005248800 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10059 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4568 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | BC026930 CH471087 U90547 U91328 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB53425 AAB82084 AAH26930 EAW55501 EAW55502 EAW55504 EAW55505 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10475 | ||||||||||||||||||||||