Mus musculus Gene: Dnmt1 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-138141.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dnmt1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA methyltransferase (cytosine-5) 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Cxxc9; Dnmt; Dnmt1o; m.MmuI; MCMT; Met-1; Met1; MommeD2; MTase | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000004099 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DNA methyltransferase (cytosine-5) 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000130816:
DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 1 has a role in the establishment and regulation of tissue-specific patterns of methylated cytosine residues. Aberrant methylation patterns are associated with certain human tumors and developmental abnormalities. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:20907206-20959888 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 40 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 96 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Mus musculus biological processes pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
PRC2 methylates histones and DNA pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
DNA methylation pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Cysteine and methionine metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PRC2 methylates histones and DNA pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
DNA methylation pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
DNA methylation pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
PRC2 methylates histones and DNA pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Cysteine and methionine metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of retinoblastoma protein
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | J3QNW0 Q3UWN4 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13433 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001199432 XM_006509989 NM_001199431 NM_001199433 NM_010066 XM_006509987 XM_006509988 XM_006509990 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS57653 CCDS57654 CCDS57655 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:94912 | ||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Dnmt1 | ||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC170598 AK136213 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | BAE22880 | ||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 13433 | ||||||||||||||||||||||||||||