Mus musculus Gene: Otub1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-138319.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Otub1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI850305 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024767 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1
OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1
OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] OTUB1 and OTUB2 negatively regulate virus-triggered type I interferon (IFN) induction and cellular antiviral response by deubiquitinating TRAF3 and -6.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000167770:
The product of this gene is a member of the OTU (ovarian tumor) superfamily of predicted cysteine proteases. The encoded protein is a highly specific ubiquitin iso-peptidase, and cleaves ubiquitin from branched poly-ubiquitin chains but not from ubiquitinated substrates. It interacts with another ubiquitin protease and an E3 ubiquitin ligase that inhibits cytokine gene transcription in the immune system. It is proposed to function in specific ubiquitin-dependent pathways, possibly by providing an editing function for polyubiquitin chain growth. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:7198202-7206316 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 61 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.203921 Mm.440389 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_134150 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29520 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||