Homo sapiens Gene: SETMAR | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14103.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SETMAR | ||||||||||||||||||
Gene Name | SET domain and mariner transposase fusion gene | ||||||||||||||||||
Synonyms | HsMar1; Mar1; METNASE | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000170364 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SET domain and mariner transposase fusion gene
SET domain and mariner transposase fusion gene
SET domain and mariner transposase fusion gene
SET domain and mariner transposase fusion gene
SET domain and mariner transposase fusion gene
SET domain and mariner transposase fusion gene
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a fusion protein that contains an N-terminal histone-lysine N-methyltransferase domain and a C-terminal mariner transposase domain. The encoded protein binds DNA and functions in DNA repair activities including non-homologous end joining and double strand break repair. The SET domain portion of this protein specifically methylates histone H3 lysines 4 and 36. This gene exists as a fusion gene only in anthropoid primates, other organisms lack mariner transposase domain. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:4303304-4317567 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | p26.1 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG |
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001243723 NM_001276325 NM_006515 XM_006713293 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2563 CCDS58814 CCDS63528 | ||||||||||||||||||
HPRD | 10225 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||