Mus musculus Gene: Pcdh1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-141384.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pcdh1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | protocadherin 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2010005A06Rik; AI585920 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000051375 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protocadherin 1
protocadherin 1
protocadherin 1
protocadherin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000156453:
This gene belongs to the protocadherin subfamily within the cadherin superfamily. The encoded protein is a membrane protein found at cell-cell boundaries. It is involved in neural cell adhesion, suggesting a possible role in neuronal development. The protein includes an extracelllular region, containing 7 cadherin-like domains, a transmembrane region and a C-terminal cytoplasmic region. Cells expressing the protein showed cell aggregation activity. Alternative splicing occurs in this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:38185915-38212053 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E0CXD4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 75599 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.36560 Mm.458851 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_029357 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29197 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:104692 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pcdh1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC133646 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 75599 | ||||||||||||||||||||||