Homo sapiens Gene: PCDH1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-50917.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PCDH1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | protocadherin 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | PC42; PCDH42 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000156453 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protocadherin 1
protocadherin 1
protocadherin 1
protocadherin 1
protocadherin 1
protocadherin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene belongs to the protocadherin subfamily within the cadherin superfamily. The encoded protein is a membrane protein found at cell-cell boundaries. It is involved in neural cell adhesion, suggesting a possible role in neuronal development. The protein includes an extracelllular region, containing 7 cadherin-like domains, a transmembrane region and a C-terminal cytoplasmic region. Cells expressing the protein showed cell aggregation activity. Alternative splicing occurs in this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:141853111-141879246 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q31.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RAX3 D6RBG2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5097 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.79769 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001278613 NM_001278615 NM_002587 NM_032420 XM_005268452 XM_005268453 XM_005268454 XM_005268455 XM_005268456 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8655 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 603626 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4267 CCDS43375 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04692 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC094107 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5097 | ||||||||||||||||||||||