Mus musculus Gene: Tpm2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-141434.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tpm2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | tropomyosin 2, beta | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Tpm-2; Trop-2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028464 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tropomyosin 2, beta
tropomyosin 2, beta
tropomyosin 2, beta
tropomyosin 2, beta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene belongs to the tropomyosin family which encodes proteins that bind to actin filaments and stabilize them by regulating access to actin modifying proteins. The encoded protein is a high molecular weight tropomyosin expressed in slow skeletal muscle. In humans, mutations in this gene are associated with nemaline myopathy, cap disease and distal arthrogryposis syndromes. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Apr 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:43514711-43523765 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A5 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 29 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Striated Muscle Contraction pathway
Smooth Muscle Contraction pathway
Muscle contraction pathway
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KEGG |
Cardiac muscle contraction pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Smooth Muscle Contraction pathway
Striated Muscle Contraction pathway
Muscle contraction pathway
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KEGG |
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Cardiac muscle contraction pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.646 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001277875 NM_001277876 NM_009416 XM_006537780 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18100 CCDS71374 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||