Version 5.4
| Homo sapiens Gene: PDZD2 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-14401.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | PDZD2 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | PDZ domain containing 2 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | AIPC; PAPIN; PDZK3; PIN1 | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000133401 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
PDZ domain containing 2
PDZ domain containing 2
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
Proteins containing PDZ domains have been shown frequently to bind the C-termini of transmembrane receptors or ion channels. They have also been shown to bind to other PDZ domain proteins and could possibly be involved in intracellular signalling. The protein encoded by this gene contains six PDZ domains and shares sequence similarity with pro-interleukin-16 (pro-IL-16). Like pro-IL-16, the encoded protein localizes to the endoplasmic reticulum and is thought to be cleaved by a caspase to produce a secreted peptide containing two PDZ domains. In addition, this gene is upregulated in primary prostate tumors and may be involved in the early stages of prostate tumorigenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 5:31639410-32110931 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | p13.3 | ||||||||||||||||||
| Transcripts | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.481819 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_178140 XM_005248270 | ||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS34137 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 10142 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||