Mus musculus Gene: Spg20 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-145164.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Spg20 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome) homolog (human) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000036580 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome) homolog (human)
spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome) homolog (human)
spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome) homolog (human)
spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome) homolog (human)
spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome) homolog (human)
spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome) homolog (human)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000133104:
This gene encodes a protein containing a MIT (Microtubule Interacting and Trafficking molecule) domain, and is implicated in regulating endosomal trafficking and mitochondria function. The protein localizes to mitochondria and partially co-localizes with microtubules. Stimulation with epidermal growth factor (EGF) results in protein translocation to the plasma membrane, and the protein functions in the degradation and intracellular trafficking of EGF receptor. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. Mutations associated with this gene cause autosomal recessive spastic paraplegia 20 (Troyer syndrome). [provided by RefSeq, Nov 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:55112108-55137322 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 32 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.235523 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001144987 NM_001144988 NM_144895 XM_006501320 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38432 CCDS50908 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||