Mus musculus Gene: Htatsf1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-147253.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Htatsf1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | HIV TAT specific factor 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1600023H17Rik; 2600017A12Rik; 2700077B20Rik; TAT-SF1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000067873 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
HIV TAT specific factor 1
HIV TAT specific factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000102241:
The protein encoded by this gene functions as a cofactor for the stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat, which binds to the HIV-1 promoter through Tat-TAR interaction. This protein may also serve as a dual-function factor to couple transcription and splicing and to facilitate their reciprocal activation. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene.[provided by RefSeq, Sep 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:57053583-57067183 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A6 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 27 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.2152 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_028242 NM_029371 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40983 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||