Mus musculus Gene: Hif3a | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-147492.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Hif3a | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | hypoxia inducible factor 3, alpha subunit | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | bHLHe17; Ipas; MOP7; NEPAS | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000004328 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
hypoxia inducible factor 3, alpha subunit
hypoxia inducible factor 3, alpha subunit
hypoxia inducible factor 3, alpha subunit
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000124440:
The protein encoded by this gene is the alpha-3 subunit of one of several alpha/beta-subunit heterodimeric transcription factors that regulate many adaptive responses to low oxygen tension (hypoxia). The alpha-3 subunit lacks the transactivation domain found in factors containing either the alpha-1 or alpha-2 subunits. It is thought that factors containing the alpha-3 subunit are negative regulators of hypoxia-inducible gene expression. Multiple alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:17031507-17062427 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cellular responses to stress pathway
Cellular response to hypoxia pathway
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha pathway
Regulation of Hypoxia-inducible Factor (HIF) by oxygen pathway
Regulation of gene expression by Hypoxia-inducible Factor pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha pathway
Regulation of gene expression by Hypoxia-inducible Factor pathway
Cellular responses to stress pathway
Developmental Biology pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
Regulation of Hypoxia-inducible Factor (HIF) by oxygen pathway
Cellular response to hypoxia pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Hypoxic and oxygen homeostasis regulation of HIF-1-alpha
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.135110 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001162950 NM_016868 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20860 CCDS52045 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||