Mus musculus Gene: Ercc6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-147857.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ercc6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000054051 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000225830:
This gene encodes a DNA-binding protein that is important in transcription-coupled excision repair. The encoded protein has ATP-stimulated ATPase activity, interacts with several transcription and excision repair proteins, and may promote complex formation at DNA repair sites. Mutations in this gene are associated with Cockayne syndrome type B and cerebrooculofacioskeletal syndrome 1. Naturally-occurring readthrough transcription occurs between this gene and the adjacent PGBD3 gene (GeneID:267004), and results in a fusion protein that shares sequence with the product of each individual gene. The readthrough locus is represented by GeneID:101243544. [provided by RefSeq, Mar 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:32513521-32580989 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 33 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Nucleotide excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
Formation of transcription-coupled NER (TC-NER) repair complex pathway
Dual incision reaction in TC-NER pathway
Transcription-coupled NER (TC-NER) pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Nucleotide Excision Repair pathway
Gene Expression pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Nucleotide excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.318310 Mm.405507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081221 XM_006519120 XM_006519122 XM_006519123 XM_006519124 XM_006519125 XM_006519126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36868 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||