Mus musculus Gene: Hoxa9 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-148014.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Hoxa9 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | homeobox A9 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | D6a9; Hox-1.7 | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000038227 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
homeobox A9
homeobox A9
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Protein Structure |
![]() |
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Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] HOXA9 plays a role in the innate immune response to bacterial infection as a modulator of NF-kappaB-dependent transcription.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is located in a cluster of developmentally and temporally regulated genes on chromosome 6 encoding proteins involved in pattern formation. These proteins contain a characteristic DNA-binding motif called a homeodomain and function in transcriptional regulation. There are four distinct clusters of similar genes on chromosomes 2, 6, 11, and 15. The protein encoded by this gene is important for hematopoeisis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:52223100-52231089 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | B3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 31 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P09631 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 15405 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4694 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010456 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20146 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:96180 | ||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Hoxa9 | ||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB005457 AB005458 AB008914 BC055059 M28449 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA78790 AAH55059 BAA25800 BAA25801 BAA25802 | ||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 15405 | ||||||||||||||||||||||||||||