Mus musculus Gene: Whsc1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-154157.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Whsc1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5830445G22Rik; 9430010A17Rik; AW555663; C130020C13Rik; D030027O06Rik; D930023B08Rik; mKIAA1090; MMSET; NSD2; Whsc1l | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000057406 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (human)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000109685:
This gene encodes a protein that contains four domains present in other developmental proteins: a PWWP domain, an HMG box, a SET domain, and a PHD-type zinc finger. It is expressed ubiquitously in early development. Wolf-Hirschhorn syndrome (WHS) is a malformation syndrome associated with a hemizygous deletion of the distal short arm of chromosome 4. This gene maps to the 165 kb WHS critical region and has also been involved in the chromosomal translocation t(4;14)(p16.3;q32.3) in multiple myelomas. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding different isoforms. Some transcript variants are nonsense-mediated mRNA (NMD) decay candidates, hence not represented as reference sequences. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:33820725-33897975 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z229 D3Z3E4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 107823 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.19892 Mm.406909 Mm.408639 Mm.450994 Mm.490310 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081102 NM_001177884 NM_175231 XM_006503658 XM_006503659 XM_006503660 XM_006503661 XM_006503662 XM_006503663 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS51467 CCDS51468 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1276574 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Whsc1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC162898 AC163329 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 107823 | ||||||||||||||||||||||