Mus musculus Gene: Fancl | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-156079.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Fancl | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Fanconi anemia, complementation group L | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2010322C19Rik; AW554273; B230118H11Rik; gcd; Phf9; Pog | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000004018 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Fanconi anemia, complementation group L
Fanconi anemia, complementation group L
Fanconi anemia, complementation group L
Fanconi anemia, complementation group L
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes the complementation group L subunit of the multimeric Fanconi anemia (FA) nuclear complex composed of proteins encoded by over ten Fanconi anemia complementation (FANC) group genes. The FA complex is necessary for protection against DNA damage. This gene product, an E3 ubiquitin ligase, catalyzes and is required for the monoubiquitination of the protein encoded by the Fanconi anemia, complementation group D2 gene, a critical step in the FA pathway (PMID: 12973351, 21229326). In mouse, mutations of this E3 ubiquitin ligase gene can lead to infertility in adult males and females, and a deletion of this gene can cause embryonic lethality in some genetic backgrounds. A pseudogene of this gene has been identified on chromosome 1. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2013] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:26386135-26471876 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A3.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 19 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
DNA Repair pathway
Fanconi Anemia pathway pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Fanconi Anemia pathway pathway
DNA Repair pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Fanconi anemia pathway
BARD1 signaling events
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67030 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.18875 Mm.392039 Mm.402037 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001277273 NM_025923 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24485 CCDS70152 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1914280 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Fancl | ||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 67030 | ||||||||||||||||||||||