Mus musculus Gene: Cd1d1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-156735.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cd1d1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | CD1d1 antigen | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI747460; CD1.1; Cd1a; Cd1d; Ly-38 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028076 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CD1d1 antigen
CD1d1 antigen
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Lipid transfer proteins saposins play an essential role in modulating human invariant natural killer T cell reactivity to antigen-presenting cells activated by inflammatory stimuli. Lipid-loaded Saposin B mediates lipid transfer onto CD1D and accelerates dissociation of CD1D-bound lipids, promoting lipid exchange.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000158473:
This gene encodes a divergent member of the CD1 family of transmembrane glycoproteins, which are structurally related to the major histocompatibility complex (MHC) proteins and form heterodimers with beta-2-microglobulin. The CD1 proteins mediate the presentation of primarily lipid and glycolipid antigens of self or microbial origin to T cells. The human genome contains five CD1 family genes organized in a cluster on chromosome 1. The CD1 family members are thought to differ in their cellular localization and specificity for particular lipid ligands. The protein encoded by this gene localizes to late endosomes and lysosomes via a tyrosine-based motif in the cytoplasmic tail. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:86995834-86999441 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Hematopoietic cell lineage pathway
Amoebiasis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Hematopoietic cell lineage pathway
Amoebiasis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.1894 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007639 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17449 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||