Mus musculus Gene: Pafah1b3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-157255.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pafah1b3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, subunit 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | mus[g]; Pafahg | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000005447 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, subunit 3
platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, subunit 3
platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, subunit 3
platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, subunit 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000079462:
This gene encodes an acetylhydrolase that catalyzes the removal of an acetyl group from the glycerol backbone of platelet-activating factor. The encoded enzyme is a subunit of the platelet-activating factor acetylhydrolase isoform 1B complex, which consists of the catalytic beta and gamma subunits and the regulatory alpha subunit. This complex functions in brain development. A translocation between this gene on chromosome 19 and the CDC-like kinase 2 gene on chromosome 1 has been observed, and was associated with mental retardation, ataxia, and atrophy of the brain. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:25295049-25297986 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 38 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Ether lipid metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Ether lipid metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.597 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008776 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20979 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||