Mus musculus Gene: Sptlc2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-160279.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sptlc2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI173915; LCB2; mKIAA0526 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021036 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000100596:
This gene encodes a long chain base subunit of serine palmitoyltransferase. Serine palmitoyltransferase, which consists of two different subunits, is the key enzyme in sphingolipid biosynthesis. It catalyzes the pyridoxal-5-prime-phosphate-dependent condensation of L-serine and palmitoyl-CoA to 3-oxosphinganine. Mutations in this gene were identified in patients with hereditary sensory neuropathy type I. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:87305058-87388355 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Sphingolipid de novo biosynthesis pathway
Metabolism pathway
Sphingolipid metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
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KEGG |
Sphingolipid metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Sphingolipid de novo biosynthesis pathway
Sphingolipid metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Sphingolipid metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.399760 Mm.451016 Mm.565 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011479 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26076 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||