Mus musculus Gene: Spnb4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-160792.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Spnb4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | spectrin beta 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1700022P15Rik; 5830426A08Rik; dyn; lnd; nmf261; nmf379; qv; ROSA62; SpbIV; Spnb4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000011751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
spectrin beta 4
spectrin beta 4
spectrin beta 4
spectrin beta 4
spectrin beta 4
spectrin beta 4
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000160460:
Spectrin is an actin crosslinking and molecular scaffold protein that links the plasma membrane to the actin cytoskeleton, and functions in the determination of cell shape, arrangement of transmembrane proteins, and organization of organelles. It is composed of two antiparallel dimers of alpha- and beta- subunits. This gene is one member of a family of beta-spectrin genes. The encoded protein localizes to the nuclear matrix, PML nuclear bodies, and cytoplasmic vesicles. A highly similar gene in the mouse is required for localization of specific membrane proteins in polarized regions of neurons. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:27356383-27447686 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q91ZE6 Q9EQM0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 80297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.409235 Mm.421849 Mm.459123 Mm.463815 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_006540437 NM_001199234 NM_001199235 NM_001199236 NM_032610 XM_006540436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS21019 CCDS57530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1890574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Sptbn4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC157561 AC158304 AF203696 AY032655 AY032692 AY032693 AY032694 AY032695 AY032696 AY032697 AY032698 AY032699 AY032700 AY032701 AY032702 AY032703 AY032704 AY032705 AY032706 AY032707 AY032708 AY032709 AY032710 AY032711 AY032712 AY032713 AY032714 AY032715 AY032716 AY032717 AY032718 AY032719 AY032720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAG35643 AAK38731 AAK49014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 80297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||