Bos taurus Gene: SPTBN4 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-637932.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SPTBN4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | spectrin beta chain, brain 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000004751 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
spectrin, beta, non-erythrocytic 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000160460:
Spectrin is an actin crosslinking and molecular scaffold protein that links the plasma membrane to the actin cytoskeleton, and functions in the determination of cell shape, arrangement of transmembrane proteins, and organization of organelles. It is composed of two antiparallel dimers of alpha- and beta- subunits. This gene is one member of a family of beta-spectrin genes. The encoded protein localizes to the nuclear matrix, PML nuclear bodies, and cytoplasmic vesicles. A highly similar gene in the mouse is required for localization of specific membrane proteins in polarized regions of neurons. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:50077666-50154685 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.105931 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001192910 XM_005218990 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||