Mus musculus Gene: Rlim | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-165932.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rlim | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein, LIM domain interacting | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AL022832; AW743871; Ha1r; Rlim1; Rnf12 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000056537 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ring finger protein, LIM domain interacting
ring finger protein, LIM domain interacting
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000131263:
The protein encoded by this gene is a RING-H2 zinc finger protein. It has been shown to be an E3 ubiquitin protein ligase that targets LIM domain binding 1 (LDB1/CLIM), and causes proteasome-dependent degradation of LDB1. This protein and LDB1 are co-repressors of LHX1/LIM-1, a homeodomain transcription factor. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Feb 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:103957163-103981284 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 28 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.427762 Mm.481086 Mm.490660 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011276 XM_006527917 XM_006527918 XM_006527919 XM_006527920 XM_006527921 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30331 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||