Mus musculus Gene: Irgm1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-166425.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Irgm1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | immunity-related GTPase family M member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Ifggd3; Ifi1; Iigp3; Iipg3; Irgm; LRG-47 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000046879 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
immunity-related GTPase family M member 1
immunity-related GTPase family M member 1
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Irgm1 is responsible for the IFN-gamma mediated induction of the antimicrobial defence system against Chlamydia trachomatis in mouse. Irgm1/Igtp knockout mice develop high bacterial burden post intrauterine infection, but subsequently clear the infection more efficiently than wt mice due to a compensatory T cell response.
|
||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000237693:
This gene encodes a member of the p47 immunity-related GTPase family. The encoded protein may play a role in the innate immune response by regulating autophagy formation in response to intracellular pathogens. Polymorphisms that affect the normal expression of this gene are associated with a susceptibility to Crohn's disease and tuberculosis.[provided by RefSeq, Oct 2010] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:48861968-48871683 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B1.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Toxoplasmosis pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Toxoplasmosis pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5NCB5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 15944 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.29938 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008326 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24588 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:107567 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Irgm1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AL645849 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 15944 | ||||||||||||||||||||||