Mus musculus Gene: Hmgcr | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-174808.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Hmgcr | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HMG-CoAR; Red | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000113161:
HMG-CoA reductase is the rate-limiting enzyme for cholesterol synthesis and is regulated via a negative feedback mechanism mediated by sterols and non-sterol metabolites derived from mevalonate, the product of the reaction catalyzed by reductase. Normally in mammalian cells this enzyme is suppressed by cholesterol derived from the internalization and degradation of low density lipoprotein (LDL) via the LDL receptor. Competitive inhibitors of the reductase induce the expression of LDL receptors in the liver, which in turn increases the catabolism of plasma LDL and lowers the plasma concentration of cholesterol, an important determinant of atherosclerosis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:96648967-96670936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | D1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Cholesterol biosynthesis pathway
PPARA activates gene expression pathway
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KEGG |
Terpenoid backbone biosynthesis pathway
Bile secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Metabolism pathway
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Cholesterol biosynthesis pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
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KEGG |
Terpenoid backbone biosynthesis pathway
Bile secretion pathway
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INOH |
Steroids metabolism pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PVG9 Q61671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 15357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.316652 Mm.489666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008255 XM_006517530 XM_006517531 XM_006517532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:96159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Hmgcr | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC154851 X07888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | CAA30734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 15357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||